sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-XK-AAK1	1	61735	248930189	1	1
TCGA-XK-AAK1	2	12784	114040908	1	1
TCGA-XK-AAK1	2	114041773	116534147	1	0
TCGA-XK-AAK1	2	116534706	162963415	1	1
TCGA-XK-AAK1	2	162963616	187774967	1	0
TCGA-XK-AAK1	2	187775433	196476350	1	1
TCGA-XK-AAK1	2	196481569	197322440	1	0
TCGA-XK-AAK1	2	197323179	198364304	1	1
TCGA-XK-AAK1	2	198366665	198611482	1	0
TCGA-XK-AAK1	2	198611705	242147305	1	1
TCGA-XK-AAK1	3	18667	26124061	1	1
TCGA-XK-AAK1	3	26124227	26481631	1	0
TCGA-XK-AAK1	3	26486153	28351896	1	1
TCGA-XK-AAK1	3	28352197	29776387	1	0
TCGA-XK-AAK1	3	29777208	71935821	1	1
TCGA-XK-AAK1	3	71937742	72679674	1	0
TCGA-XK-AAK1	3	72680437	73751737	1	1
TCGA-XK-AAK1	3	73752431	76364669	1	0
TCGA-XK-AAK1	3	76369173	88039273	1	1
TCGA-XK-AAK1	3	88039526	88264812	1	0
TCGA-XK-AAK1	3	88268069	89456708	1	1
TCGA-XK-AAK1	3	89456920	90453712	1	0
TCGA-XK-AAK1	3	93800634	108707905	1	1
TCGA-XK-AAK1	3	108716108	108900154	1	0
TCGA-XK-AAK1	3	108900273	198169247	1	1
TCGA-XK-AAK1	4	12281	46640117	1	1
TCGA-XK-AAK1	4	46643946	46868963	1	0
TCGA-XK-AAK1	4	46872771	46905260	0	0
TCGA-XK-AAK1	4	46909192	47060865	1	0
TCGA-XK-AAK1	4	47060922	60978664	1	1
TCGA-XK-AAK1	4	60980660	69395640	1	0
TCGA-XK-AAK1	4	69397964	84900747	1	1
TCGA-XK-AAK1	4	84901181	105993256	1	0
TCGA-XK-AAK1	4	106000437	172572914	1	1
TCGA-XK-AAK1	4	172578254	172620334	1	0
TCGA-XK-AAK1	4	172622723	176366126	1	1
TCGA-XK-AAK1	4	176369794	176835899	1	0
TCGA-XK-AAK1	4	176836151	179674944	1	1
TCGA-XK-AAK1	4	179677526	183146093	1	0
TCGA-XK-AAK1	4	183148060	190106768	1	1
TCGA-XK-AAK1	5	15532	5956693	1	1
TCGA-XK-AAK1	5	5957772	8951532	1	0
TCGA-XK-AAK1	5	8955279	31280095	1	1
TCGA-XK-AAK1	5	31281692	31308154	1	0
TCGA-XK-AAK1	5	31316225	98567454	1	1
TCGA-XK-AAK1	5	98569713	99157253	1	0
TCGA-XK-AAK1	5	99161187	100664993	1	1
TCGA-XK-AAK1	5	100667844	101146499	1	0
TCGA-XK-AAK1	5	101148960	102162428	1	1
TCGA-XK-AAK1	5	102162585	102239771	1	0
TCGA-XK-AAK1	5	102246504	102768779	1	1
TCGA-XK-AAK1	5	102771762	103332591	1	0
TCGA-XK-AAK1	5	103333282	181363319	1	1
TCGA-XK-AAK1	6	149661	67659290	1	1
TCGA-XK-AAK1	6	67660306	126994573	1	0
TCGA-XK-AAK1	6	126994622	170741917	1	1
TCGA-XK-AAK1	7	43259	159334314	1	1
TCGA-XK-AAK1	8	81254	2038435	1	1
TCGA-XK-AAK1	8	2043999	2067934	1	0
TCGA-XK-AAK1	8	2074299	4728582	1	1
TCGA-XK-AAK1	8	4731646	6342881	1	0
TCGA-XK-AAK1	8	6342892	8283921	1	1
TCGA-XK-AAK1	8	8287525	31755300	1	0
TCGA-XK-AAK1	8	31755370	31976407	1	1
TCGA-XK-AAK1	8	31977166	35723308	1	0
TCGA-XK-AAK1	8	35723795	37377612	1	1
TCGA-XK-AAK1	8	37378032	37526681	1	0
TCGA-XK-AAK1	8	37528724	145072769	1	1
TCGA-XK-AAK1	9	46587	138200944	1	1
TCGA-XK-AAK1	10	26823	133769379	1	1
TCGA-XK-AAK1	11	198572	36983933	1	1
TCGA-XK-AAK1	11	36995336	37060987	1	0
TCGA-XK-AAK1	11	37064576	37239427	1	1
TCGA-XK-AAK1	11	37240153	37411079	1	0
TCGA-XK-AAK1	11	37411524	38518088	1	1
TCGA-XK-AAK1	11	38520323	50810146	1	0
TCGA-XK-AAK1	11	54554851	135074876	1	1
TCGA-XK-AAK1	12	51460	133201603	1	1
TCGA-XK-AAK1	13	18452809	28345325	1	1
TCGA-XK-AAK1	13	28347144	28664761	1	0
TCGA-XK-AAK1	13	28664931	28955363	1	1
TCGA-XK-AAK1	13	28955413	83618276	1	0
TCGA-XK-AAK1	13	83618715	114342922	1	1
TCGA-XK-AAK1	14	18225647	106877229	1	1
TCGA-XK-AAK1	15	19811075	101928837	1	1
TCGA-XK-AAK1	16	10777	90221127	1	1
TCGA-XK-AAK1	17	150733	83090856	1	1
TCGA-XK-AAK1	18	48133	80257174	1	1
TCGA-XK-AAK1	19	90910	58586487	1	1
TCGA-XK-AAK1	20	80664	64324800	1	1
TCGA-XK-AAK1	21	10336543	46677045	1	1
TCGA-XK-AAK1	22	15294545	50796027	1	1
TCGA-XK-AAK1	X	251810	895885	1	1
TCGA-XK-AAK1	X	920250	2776199	1	0
TCGA-XK-AAK1	X	2785350	3763329	0	0
TCGA-XK-AAK1	X	3771394	4098759	1	0
TCGA-XK-AAK1	X	4100645	4159843	0	0
TCGA-XK-AAK1	X	4165138	5556431	1	0
TCGA-XK-AAK1	X	5559865	5857883	0	0
TCGA-XK-AAK1	X	5861539	155699837	1	0
TCGA-XK-AAK1	X	155733777	156004181	1	1
