sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-49-AAR9	1	61735	121741181	4	0
TCGA-49-AAR9	1	143285278	189753481	4	2
TCGA-49-AAR9	1	189759961	200320466	4	4
TCGA-49-AAR9	1	200320482	237113755	4	3
TCGA-49-AAR9	1	237113798	242708510	4	4
TCGA-49-AAR9	1	242709407	248930189	4	3
TCGA-49-AAR9	2	12784	7050495	4	2
TCGA-49-AAR9	2	7051930	7184448	4	4
TCGA-49-AAR9	2	7186877	9061677	4	2
TCGA-49-AAR9	2	9065024	9320105	6	2
TCGA-49-AAR9	2	9320861	11113965	4	2
TCGA-49-AAR9	2	11117379	13491583	4	4
TCGA-49-AAR9	2	13497334	26243608	4	2
TCGA-49-AAR9	2	26248028	26356718	9	4
TCGA-49-AAR9	2	26356888	27408722	4	4
TCGA-49-AAR9	2	27412596	28058239	7	4
TCGA-49-AAR9	2	28066256	43360312	4	2
TCGA-49-AAR9	2	43360365	43843206	7	4
TCGA-49-AAR9	2	43843796	44519905	4	4
TCGA-49-AAR9	2	44521051	48971041	4	2
TCGA-49-AAR9	2	48971373	50156832	5	4
TCGA-49-AAR9	2	50156903	51341933	4	2
TCGA-49-AAR9	2	51342377	57362021	5	4
TCGA-49-AAR9	2	57365517	92117758	4	2
TCGA-49-AAR9	2	94662162	103339684	4	0
TCGA-49-AAR9	2	103349964	103478194	7	0
TCGA-49-AAR9	2	103485515	129643363	4	0
TCGA-49-AAR9	2	129644313	129871697	5	2
TCGA-49-AAR9	2	129871788	190973616	4	0
TCGA-49-AAR9	2	190973622	192627198	6	0
TCGA-49-AAR9	2	192628499	242147305	4	0
TCGA-49-AAR9	3	18667	18731278	7	0
TCGA-49-AAR9	3	18733492	52243020	3	0
TCGA-49-AAR9	3	52250696	52692360	6	0
TCGA-49-AAR9	3	52693241	59836254	3	0
TCGA-49-AAR9	3	59838055	60412423	3	2
TCGA-49-AAR9	3	60412570	60529003	2	0
TCGA-49-AAR9	3	60530448	60702969	3	2
TCGA-49-AAR9	3	60703662	60931574	2	0
TCGA-49-AAR9	3	60931813	63678884	3	2
TCGA-49-AAR9	3	63681852	64972713	7	2
TCGA-49-AAR9	3	64975715	66351494	8	2
TCGA-49-AAR9	3	66352860	67062829	6	2
TCGA-49-AAR9	3	67063353	68052589	6	0
TCGA-49-AAR9	3	68053093	69143606	4	2
TCGA-49-AAR9	3	69148306	71805002	2	2
TCGA-49-AAR9	3	71805877	71906789	4	2
TCGA-49-AAR9	3	71907291	72505412	2	2
TCGA-49-AAR9	3	72509848	73927087	4	2
TCGA-49-AAR9	3	73927363	93800634	2	2
TCGA-49-AAR9	3	93801172	95128187	4	0
TCGA-49-AAR9	3	95130690	105031800	4	2
TCGA-49-AAR9	3	105031981	105462085	4	0
TCGA-49-AAR9	3	105466639	105871403	4	2
TCGA-49-AAR9	3	105871689	107504889	4	0
TCGA-49-AAR9	3	107505199	108198184	4	2
TCGA-49-AAR9	3	108198380	108296482	5	4
TCGA-49-AAR9	3	108297963	110163647	4	2
TCGA-49-AAR9	3	110169702	119036472	4	0
TCGA-49-AAR9	3	119051205	119427401	4	1
TCGA-49-AAR9	3	119431644	119750178	4	0
TCGA-49-AAR9	3	119750592	120433651	4	2
TCGA-49-AAR9	3	120434617	141767338	4	0
TCGA-49-AAR9	3	141767741	198169247	4	2
TCGA-49-AAR9	4	12281	46941670	2	2
TCGA-49-AAR9	4	46944054	48362259	4	2
TCGA-49-AAR9	4	48370906	49577150	2	2
TCGA-49-AAR9	4	49582092	114320939	4	0
TCGA-49-AAR9	4	114322585	115817968	6	0
TCGA-49-AAR9	4	115818434	151162561	4	0
TCGA-49-AAR9	4	151168121	151416193	6	0
TCGA-49-AAR9	4	151418389	190106768	4	0
TCGA-49-AAR9	5	15532	7066614	4	2
TCGA-49-AAR9	5	7066786	7210460	7	2
TCGA-49-AAR9	5	7210514	11762918	4	2
TCGA-49-AAR9	5	11764257	12864509	4	0
TCGA-49-AAR9	5	12869750	18664987	4	2
TCGA-49-AAR9	5	18666713	20615971	4	0
TCGA-49-AAR9	5	20622157	42119520	4	2
TCGA-49-AAR9	5	42119888	46377225	5	4
TCGA-49-AAR9	5	46381680	55152337	4	2
TCGA-49-AAR9	5	55152425	55911219	6	0
TCGA-49-AAR9	5	55911722	59828898	6	2
TCGA-49-AAR9	5	59830508	63071897	6	0
TCGA-49-AAR9	5	63081092	65154481	4	0
TCGA-49-AAR9	5	65154610	154837045	2	0
TCGA-49-AAR9	5	154837461	181363319	2	2
TCGA-49-AAR9	6	149661	4812289	4	0
TCGA-49-AAR9	6	4815528	6082175	4	4
TCGA-49-AAR9	6	6082558	8389896	4	2
TCGA-49-AAR9	6	8391311	9096304	5	4
TCGA-49-AAR9	6	9098397	11317130	4	0
TCGA-49-AAR9	6	11320491	11628931	4	4
TCGA-49-AAR9	6	11634489	11976543	4	2
TCGA-49-AAR9	6	11977919	50946613	4	0
TCGA-49-AAR9	6	50947083	52764971	4	4
TCGA-49-AAR9	6	52765266	53169896	4	2
TCGA-49-AAR9	6	53170707	53576158	4	4
TCGA-49-AAR9	6	53579988	54564862	6	5
TCGA-49-AAR9	6	54565481	55360286	5	2
TCGA-49-AAR9	6	55372925	56649667	4	0
TCGA-49-AAR9	6	56651818	60523422	2	0
TCGA-49-AAR9	6	60523729	63059584	4	2
TCGA-49-AAR9	6	63059648	64087155	5	4
TCGA-49-AAR9	6	64087504	65112412	4	2
TCGA-49-AAR9	6	65114789	75229552	4	0
TCGA-49-AAR9	6	75230989	170741917	2	0
TCGA-49-AAR9	7	43259	23458566	4	0
TCGA-49-AAR9	7	23461475	38384464	2	0
TCGA-49-AAR9	7	38384727	38495159	2	2
TCGA-49-AAR9	7	38495560	46263995	2	0
TCGA-49-AAR9	7	46265224	46471795	5	2
TCGA-49-AAR9	7	46472247	52097285	2	0
TCGA-49-AAR9	7	52097345	52907671	5	2
TCGA-49-AAR9	7	52909127	63730229	2	0
TCGA-49-AAR9	7	63792452	75998256	2	2
TCGA-49-AAR9	7	76002168	78755339	2	0
TCGA-49-AAR9	7	78759945	82228449	2	2
TCGA-49-AAR9	7	82228577	84289446	4	0
TCGA-49-AAR9	7	84292473	90425430	2	0
TCGA-49-AAR9	7	90425539	92055101	2	2
TCGA-49-AAR9	7	92055633	94076908	2	0
TCGA-49-AAR9	7	94078846	94419374	2	2
TCGA-49-AAR9	7	94424413	99750957	2	0
TCGA-49-AAR9	7	99753295	99957146	4	2
TCGA-49-AAR9	7	99968641	109622458	2	0
TCGA-49-AAR9	7	109623968	111131505	4	0
TCGA-49-AAR9	7	111131776	112500375	4	2
TCGA-49-AAR9	7	112502412	148848879	2	2
TCGA-49-AAR9	7	148854510	150915542	4	2
TCGA-49-AAR9	7	150915830	158219002	2	2
TCGA-49-AAR9	7	158227455	159334314	2	0
TCGA-49-AAR9	8	81254	10002570	2	0
TCGA-49-AAR9	8	10004406	10943384	2	2
TCGA-49-AAR9	8	10946107	11414699	4	2
TCGA-49-AAR9	8	11420810	11655804	2	0
TCGA-49-AAR9	8	11656562	12376891	2	2
TCGA-49-AAR9	8	12382326	38867454	2	0
TCGA-49-AAR9	8	38870419	40266401	4	2
TCGA-49-AAR9	8	40267280	40913994	2	0
TCGA-49-AAR9	8	40914477	46997177	2	2
TCGA-49-AAR9	8	46998518	49112372	4	2
TCGA-49-AAR9	8	49112385	50300123	7	2
TCGA-49-AAR9	8	50302484	50511507	5	2
TCGA-49-AAR9	8	50523181	53209714	2	2
TCGA-49-AAR9	8	53212683	55193239	11	2
TCGA-49-AAR9	8	55200371	57935654	2	0
TCGA-49-AAR9	8	57937576	59539354	9	2
TCGA-49-AAR9	8	59539472	63945717	4	2
TCGA-49-AAR9	8	63948012	82054357	2	2
TCGA-49-AAR9	8	82055355	83722947	4	2
TCGA-49-AAR9	8	83723619	93628068	2	2
TCGA-49-AAR9	8	93628428	96009235	4	2
TCGA-49-AAR9	8	96009937	145072769	2	2
TCGA-49-AAR9	9	46587	1381203	2	2
TCGA-49-AAR9	9	1382843	6499117	2	0
TCGA-49-AAR9	9	6501060	8644711	2	2
TCGA-49-AAR9	9	8646021	14393855	2	0
TCGA-49-AAR9	9	14394246	17477661	2	2
TCGA-49-AAR9	9	17485384	33922105	2	0
TCGA-49-AAR9	9	33923775	34277533	2	2
TCGA-49-AAR9	9	34277810	42995504	2	0
TCGA-49-AAR9	9	60840363	68696336	4	0
TCGA-49-AAR9	9	68698826	69660406	2	0
TCGA-49-AAR9	9	69665775	69849158	7	0
TCGA-49-AAR9	9	69851359	73526556	2	0
TCGA-49-AAR9	9	73526742	94420468	4	0
TCGA-49-AAR9	9	94429097	94683725	6	0
TCGA-49-AAR9	9	94684030	120346935	4	0
TCGA-49-AAR9	9	120348042	121679569	6	0
TCGA-49-AAR9	9	121679761	138200944	4	0
TCGA-49-AAR9	10	26823	9444005	2	0
TCGA-49-AAR9	10	9445201	75585203	2	2
TCGA-49-AAR9	10	75587415	75626654	1	0
TCGA-49-AAR9	10	75629235	133769379	2	2
TCGA-49-AAR9	11	198572	30736953	3	0
TCGA-49-AAR9	11	30737667	32228971	3	2
TCGA-49-AAR9	11	32229232	33358833	2	2
TCGA-49-AAR9	11	33361539	34865551	2	0
TCGA-49-AAR9	11	34865911	35292752	2	2
TCGA-49-AAR9	11	35298537	35576110	4	2
TCGA-49-AAR9	11	35579938	41389256	2	2
TCGA-49-AAR9	11	41390464	42661947	2	0
TCGA-49-AAR9	11	42664086	54934154	2	2
TCGA-49-AAR9	11	54934169	55739072	2	0
TCGA-49-AAR9	11	55740691	75957516	2	2
TCGA-49-AAR9	11	75957591	76764685	4	2
TCGA-49-AAR9	11	76766128	103296959	2	2
TCGA-49-AAR9	11	103297513	105909729	4	2
TCGA-49-AAR9	11	105909752	106428632	2	2
TCGA-49-AAR9	11	106428683	106661462	5	2
TCGA-49-AAR9	11	106663091	127539032	2	2
TCGA-49-AAR9	11	127539398	129075349	4	2
TCGA-49-AAR9	11	129083056	135074876	2	2
TCGA-49-AAR9	12	51460	8552799	3	2
TCGA-49-AAR9	12	8552810	21595144	2	2
TCGA-49-AAR9	12	21597741	23032409	35	1
TCGA-49-AAR9	12	23032641	23455743	43	2
TCGA-49-AAR9	12	23458780	23864241	11	1
TCGA-49-AAR9	12	23869226	25303305	47	1
TCGA-49-AAR9	12	25308105	31387791	10	2
TCGA-49-AAR9	12	31388284	37464142	13	2
TCGA-49-AAR9	12	37469922	51707604	2	2
TCGA-49-AAR9	12	51709317	54971186	6	2
TCGA-49-AAR9	12	54971186	128990479	4	2
TCGA-49-AAR9	12	128990587	129001923	2	1
TCGA-49-AAR9	12	129002394	130003843	2	0
TCGA-49-AAR9	12	130004089	131892485	4	0
TCGA-49-AAR9	12	131892503	133201603	2	0
TCGA-49-AAR9	13	18452809	22214072	4	0
TCGA-49-AAR9	13	22214167	22959233	2	0
TCGA-49-AAR9	13	22971458	23445207	5	0
TCGA-49-AAR9	13	23447557	26480322	2	0
TCGA-49-AAR9	13	26484883	28318120	4	0
TCGA-49-AAR9	13	28318516	29098110	7	0
TCGA-49-AAR9	13	29103505	42823846	2	0
TCGA-49-AAR9	13	42824037	44334533	5	0
TCGA-49-AAR9	13	44334605	45506549	6	0
TCGA-49-AAR9	13	45512494	73090509	2	0
TCGA-49-AAR9	13	73100475	74200682	3	0
TCGA-49-AAR9	13	74201138	114342922	2	0
TCGA-49-AAR9	14	18225647	75969602	2	2
TCGA-49-AAR9	14	75970785	106877229	2	1
TCGA-49-AAR9	15	19811075	27868658	2	2
TCGA-49-AAR9	15	27868955	29361679	4	2
TCGA-49-AAR9	15	29361793	87097669	2	2
TCGA-49-AAR9	15	87101831	101928837	4	2
TCGA-49-AAR9	16	10777	597281	2	2
TCGA-49-AAR9	16	597297	2216802	4	2
TCGA-49-AAR9	16	2218348	9252930	2	2
TCGA-49-AAR9	16	9254007	9709899	4	2
TCGA-49-AAR9	16	9712334	90221127	2	2
TCGA-49-AAR9	17	150733	21624398	2	0
TCGA-49-AAR9	17	21626635	35407479	2	2
TCGA-49-AAR9	17	35418429	37253880	4	2
TCGA-49-AAR9	17	37259622	61373778	2	2
TCGA-49-AAR9	17	61376097	67398907	4	2
TCGA-49-AAR9	17	67398942	81675181	4	4
TCGA-49-AAR9	17	81677217	83090856	6	4
TCGA-49-AAR9	18	48133	25153864	4	0
TCGA-49-AAR9	18	25154136	27718970	2	0
TCGA-49-AAR9	18	27719865	33161527	4	0
TCGA-49-AAR9	18	33161563	33569970	6	0
TCGA-49-AAR9	18	33579315	35273085	4	0
TCGA-49-AAR9	18	35278826	61563302	2	0
TCGA-49-AAR9	18	61564558	80257174	4	0
TCGA-49-AAR9	19	90910	24324365	2	0
TCGA-49-AAR9	19	24324370	34846577	4	0
TCGA-49-AAR9	19	34846630	46279320	6	0
TCGA-49-AAR9	19	46279349	48138317	4	0
TCGA-49-AAR9	19	48141972	49557854	6	0
TCGA-49-AAR9	19	49558134	54515214	4	0
TCGA-49-AAR9	19	54518264	58586487	6	0
TCGA-49-AAR9	20	80664	4839957	4	0
TCGA-49-AAR9	20	4840719	11039457	4	2
TCGA-49-AAR9	20	11039666	14919115	4	1
TCGA-49-AAR9	20	14919149	15052669	2	1
TCGA-49-AAR9	20	15054557	15200751	4	1
TCGA-49-AAR9	20	15200944	15559485	4	0
TCGA-49-AAR9	20	15561967	39144913	4	1
TCGA-49-AAR9	20	39146788	43955594	4	3
TCGA-49-AAR9	20	43955758	61707906	4	1
TCGA-49-AAR9	20	61713053	64324800	6	1
TCGA-49-AAR9	21	10336543	23162416	2	2
TCGA-49-AAR9	21	23162543	29830158	2	0
TCGA-49-AAR9	21	29835350	30063847	11	0
TCGA-49-AAR9	21	30063966	46677045	2	0
TCGA-49-AAR9	22	15294545	50796027	2	0
TCGA-49-AAR9	X	251810	1464647	4	0
TCGA-49-AAR9	X	1471764	2776199	4	1
TCGA-49-AAR9	X	2785350	37926282	5	0
TCGA-49-AAR9	X	37929771	62538453	4	0
TCGA-49-AAR9	X	62554105	125927625	2	0
TCGA-49-AAR9	X	125932194	126055097	5	0
TCGA-49-AAR9	X	126064100	135788901	2	0
TCGA-49-AAR9	X	135792668	137309781	4	0
TCGA-49-AAR9	X	137310317	155699837	2	0
TCGA-49-AAR9	X	155733777	155806936	6	1
TCGA-49-AAR9	X	155807893	156004181	5	1
